リベリカ系コーヒーは3種だった――Liberica・excelsa・klainei、そして2026年hybrid解析へ

遺伝・ゲノム・育種

2025年のNature Plants研究は、従来Coffea liberica内のvariationとして扱われることが多かったLiberica系統を、genomic・morphology・distributionからC. liberica、C. dewevrei(excelsa)、C. klaineiの3 speciesへ区分することを支持しました。

3つのmonophyletic lineage

Liberica系コーヒー3種の分布と系統解析

Angiosperms353と2,240 exon-region SNPsの解析で3群は明確に分かれ、形態と野生分布も対応しました。再分類によりknown Coffea speciesは131から133へ増えます。

現在の世界生産は“1〜2%”よりはるかに少ない

論文はLiberica/excelsaの現在生産量を1,000 t未満と推定し、Arabica+robusta約1,000万t規模の2024 exportに対して約0.01%相当と説明しています。旧来の1〜2%という数字は歴史的dataの転用です。

2026年、Liberica×excelsa hybridがgenomeで確認された

2026年Scientific Reports続報は113 accessions・7,618 SNPsを解析し、栽培地でC. libericaC. dewevreiが容易にhybridizeし、fertile progenyと幅広いgenomic admixtureを作ることを確認しました。特にSarawak farm accessionsでadmixtureが多く、研究者らはhybrid名Coffea × libexを提案しています。

seed sizeやparchment thicknessなどagronomic traitも中間値・admixtureとの関係を示し、breeding resourceとして具体性が増しました。

climate-resilient coffee候補だが、Arabica/robustaの置換が決まったわけではない

excelsaの高温・低降雨への適応性は注目されますが、品質、yield、processing、disease、consumer acceptance、地域適応を含むvalue-chain validationが必要です。

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参考文献

  • Davis AP et al. Genomic data define species delimitation in Liberica coffee… Nature Plants. 2025. https://doi.org/10.1038/s41477-025-02073-y
  • Davis AP et al. Genomic elucidation of hybridization between Liberica and excelsa coffee… Scientific Reports. 2026;16:22107. https://doi.org/10.1038/s41598-026-49305-5

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