遺伝・ゲノム・育種 植物eccDNAの全長地図――Arabidopsisで見えたcentromere hotspot・TE・epigenetic regulation
CIDER-SeqでArabidopsis full-length eccDNAを地図化するとcentromere周辺とTE由来circleが多く、epigenetic mutantでpopulationも変化。各eccDNAの機能はまだ未確定です。
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遺伝・ゲノム・育種 日本ダイズのゲノムは世界とどう違う？――462系統パンゲノムと構造変異、2件の訂正まで読む
日本7系統を含む11ゲノム参照と世界462系統のパンゲノムから、日本・米国ダイズの構造変異と選抜の違いが見えました。2025年に出た2件のAuthor Correctionも含め、訂正済みVORを読み直します。
遺伝・ゲノム・育種 AI育種シミュレーションはどこまで「育種」なのか――合成データ中心のbioRxiv概念実証を読む
2025年bioRxivのAI育種platformはGNN・digital twin・GANなどを統合した概念実証ですが、主要検証はsynthetic dataで、実植物の新品種や圃場耐性を実証した研究ではありません。
遺伝・ゲノム・育種 交配・自殖・クローンでブドウゲノムはどう変わる？――Pinot Noir系譜が示す3つの繁殖戦略
Pinot Noir系譜の比較で、selfingはheterozygous deleterious SNPを62%、SVを65%減少。一方、9世代後も4.3% genomeがrepulsion-phase linkageによりheterozygousに残りました。
遺伝・ゲノム・育種 トウモロコシ支柱根をゲノムから読む――倒伏抵抗性3形質のGWASとgenomic selection
トウモロコシbrace root 3形質のGWASで22 SNP・50 candidate geneを検出し、genomic prediction accuracyは0.36〜0.51。単一の支柱根形成スイッチ遺伝子を確定した研究ではありません。
遺伝・ゲノム・育種 小麦育種の現在地2026――パンゲノム・ゲノム編集と、英国・EUで動いた規制
小麦育種ではパンゲノム、ゲノム編集、speed breedingが進展。さらにEnglandでは2025年にprecision breeding制度が実装され、EUも2026年にNGT植物規則を成立させました。科学と規制を2026年版へ更新します。
遺伝・ゲノム・育種 ダイズの莢が割れにくくなった理由――Sh1とPdh1、2つの自然変異が作った栽培化形質
ダイズのshattering resistanceはSh1とPdh1という近接2遺伝子の自然変異を栽培化で選抜した結果でした。Sh1はabscission layer、Pdh1はpod wall torsionを別経路で制御します。
遺伝・ゲノム・育種 植物の「トゲ」は同じものではない――prickle形成を150百万年つないだLOG遺伝子
Solanumで少なくとも16回のprickle lossにLOG family変異が関与し、roseやriceを含む150百万年以上離れた系統でも同じhormone-activation programが再利用されていました。
遺伝・ゲノム・育種 トマトMiMeで4祖父母のhaplotypeを丸ごと足す――clonal gameteから4-Hap tetraploidへ
tomato SlSPO11-1/REC8/TAM MiMeでunreduced clonal gameteを作り、2つのhybridから4祖父母haplotypeを保持した4-Hap tetraploidを作出。polyploid genome designのproof-of-conceptです。
遺伝・ゲノム・育種 唐辛子をT2T genomeで読む――辛味はどこで生まれ、なぜplacentaだけでcapsaicinoidを作るのか
辛味C. annuumと非辛味C. rhomboideumのT2T genomeから、capsaicinoid pathwayの進化とplacenta-specific open chromatinを解析。辛味はcoding geneだけでなくregulatory architectureにも依存します。